Povinnost analytického členění účtu DPH přímo stanovena není, nicméně pro kontrolu evidence DPH a správného sestavení Přiznání k DPH je vhodně účet 343 analyticky členit (vstup x výstup, základní x snížené sazby, přenesená daňová povinnost atd.). Je vhodné účet 343 - Daň z přidané hodnoty analyticky členit tak, aby bylo možné snadno sestavit přiznání k DPH resp. zkontrolovat sestavené přiznání k DPH. Je tedy vhodné analytiku účtu 343 členit tak, aby zůstatky jednotlivých analytických účtů DPH korespondovaly s jednotlivými řádky Přiznání k DPH. Účetní jednotka v případě potřeby musí prokázat finančnímu orgánu údaje uvedené v daňovém přiznání k DPH, tj. výši daňového závazku příp. výši nároku na nadměrný odpočet za zdaňovací období (tzv. záznamová povinnost).
Volba analytiky účtu 343 závisí také na tom, jakým způsobem účetní SW používaný u plátce DPH tvoří toto přiznání k DPH. Většina účetních SW plní přiznání k DPH z knih analytické evidence (tj. z vydaných faktur, přijatých faktur, pokladních dokladů, interních dokladů, dokladů o přenesení daňové povinnosti atd.) na základě použitého kódu členění DPH, pak volba analytiky účtu DPH slouží především pro kontrolu vyplnění přiznání k DPH, není tedy bezpodmínečně nutná pro jeho sestavení. Jiné účetní SW plní přiznání k DPH ze zaúčtování DPH, tj. v závislosti na nastavení analytiky k účtu 343. Pro přehlednost je v obou případech zpravidla vhodné použít například následující analytické členění účtu 343:
Na konci účetního období (tj. alespoň jednou ročně) je vhodné jednotlivé analytické účty DPH mezi sebou vyrovnat tak, aby se jejich v daňových přiznáních již uplatněné částky nepřeváděly do dalších let, protože pak by se na těchto analytikách kumulovaly předpisy DPH na vstupu resp. výstupu i za předchozí roky:
Pokud se o DPH správně účtovalo, správně sestavovalo přiznání k DPH a odvádělo DPH, k rozvahovému dni budou mít jednotlivé analytické účty 343 zůstatky ve výši DPH uplatněného až v následujícím období (např. u přijaté faktury zaúčtované v prosinci s odpočtem DPH uplatněným až v lednu). Účet 343 900 pak bude mít zůstatek ve výši závazku příp. pohledávky (při nadměrném odpočtu) vůči finančnímu orgánu za poslední zdaňovací období - prosinec příp. i listopad resp. 4. čtvrtletí. Jde tedy o dobrou kontrolu účtování a evidence DPH v účetní jednotce. Nicméně, existují i další varianty účtování o DPH.